在工厂化循环水养殖系统中，氮元素是普遍存在的，残饵粪便等等都有它的踪影，它是构成蛋白质的必要元素。

　　鱼类在生长过程中不断的摄食饲料，消化利用饲料中的蛋白质后，会排出氨氮，排出的粪便中含有的蛋白质也会发酵产生氨氮等物质，氨对于鱼类是剧毒的，它能使鱼类血液中的蛋白质变性而失去生理功能，导致鱼类的死亡。就像一条刚死的鱼是没有味的，腐败时就会产生刺鼻的臭味，这里边就有氨的味道。

　　有人认为鱼的排泄物可以当作蔬菜的氮肥，可蔬菜根本无法直接利用鱼类排泄物。这些排泄物必须在那些腐生细菌的“帮助”下，变成一些小分子无机物如氨、硫化氢等(都是剧毒物)。硝化细菌就把氨转化成蔬菜可以直接利用的硝酸盐，这才把那些蔬菜养得肥肥壮壮的，鱼儿也避免了氨毒之苦。

　　水产品养殖池的水处理系统，包括养殖池、第一水泵、过滤器、脱气膜、真空泵、消毒池、冷暖型冷水机、气浮泵、充氧管、生物滤池和第二水泵;水产品养殖池的水处理方法，该方法通过对养殖池内的水进行增氧、分离、过滤、脱气、消毒、脱氮等处理，能提高鲜活水产口的存活率，从而降低养殖成本，提高经济效益，而且回收过滤后的滤渣和脱气后的废气，通过生物滤池处理，更加绿色环保，生物滤池处理后排出的水可以做为回用水或直接排入自然水体中。

　　曝气生物滤池工艺是一种集曝气、高滤速、截留悬浮物、定期反冲洗于一体适合高效、低耗、自控程度高的污水再生工艺，可通过滤料比表面积大的特点，可富集大量世代周期较长的硝化菌，实现低浓度氨氮的高效去除等特点，有效弥补循环养殖系统的弊端，使其在密闭循环水养殖系统高效应用。

　　生物滤器是循环水系统的核心水处理装置，其在稳定循环水系统水环境方面占有十分重要的地位。通过附着在生物载体或滤料表面的微生物吸附、截留、分解、转化养殖水体中对鱼类有害的有机污染物(如悬浮颗粒物以及氨氮、亚硝酸盐氮等含氮污染物)实现对水体的净化作用。